Phát biểu khai mạc Đại hội, đồng chí Nguyễn Trường Nam, Bí thư Đoàn TNCS Hồ Chí Minh Cơ quan Bộ Y tế nhiệm kỳ 2012-2017 cho biết, trong nhiệm kỳ qua dưới sự chỉ đạo của Đảng ủy Bộ Y tế, Đoàn khối các cơ quan Trung ương, Ban chấp hành (BCH) Đoàn thanh niên cơ quan Bộ Y tế luôn có ý thức kỷ luật và trách nhiệm cao, luôn đoàn kết tạo sự thống nhất trong nhận thức và hành động, kịp thời cụ thể hóa các chỉ thị nghị quyết của Đảng ủy, của đoàn cấp trên.
Về công tác giáo dục chính trị, tư tưởng, công tác tuyên truyền, phổ biến các Nghị quyết của Đảng, của Đoàn, chính sách pháp luật của Nhà nước đã được Đoàn thanh niên Cơ quan Bộ thực hiện nghiêm túc. Bên cạnh đó, Đoàn thanh niên Cơ quan Bộ cũng tích cực lồng ghép công tác sinh hoạt chính trị tư tưởng với công tác tuyên truyền, phổ biến, học tập đường lối, chủ trương của Đảng và chính sách, pháp luật của Nhà nước; tích cực đẩy mạnh công tác tuyên truyền, giáo dục chính trị, tư tưởng đạo đức, lối sống văn hóa cho đoàn viên, thanh niên trong toàn đoàn. Trong quá trình lãnh đạo, chỉ đạo, BCH đoàn luôn phát huy tinh thần trách nhiệm cao, thực hiện tốt nguyên tắc tập trung dân chủ, phát huy sức mạnh đoàn kết. Mỗi đồng chí trong BCH đều khắc phục khó khăn, gương mẫu đi đầu trong công tác để hoàn thành tốt công việc; không ngừng đổi mới, nâng cao chất lượng, phương thức hoạt động của Đoàn cơ quan Bộ nói chung và các Chi đoàn/liên chi đoàn nói riêng nhằm hướng tới xây dựng và củng cố công tác đoàn đoàn vững mạnh.
Về việc thực hiện các phong trào, Đoàn thanh niên Cơ quan Bộ đã chủ động, tích cực triển khai các hoạt động, phong trào đoàn gắn với đặc thù chuyên môn của khối cơ quan tham mưu giúp việc lãnh đạo Bộ. nhiều Đoàn viên thanh niên đã trực tiếp tham gia và có đóng góp tích cực trong nhiều công trình nghiên cứu góp phần vào công cuộc chăm sóc sức khỏe người dân. Bên cạnh đó, Đoàn thanh niên Cơ quan Bộ đã tham gia và đóng góp tích cực trong nhiều hoạt động, đặc biệt là các chương trình hoạt động đền ơn đáp nghĩa, phong trào tình nguyện vì sức khỏe cộng đồng, hướng về nguồn cội, hoạt động mang âm nhạc đến bệnh viện, phong trào xung kích bảo vệ Tổ quốc, giữ gìn an ninh chính trị, trật tự an toàn xã hội, hưởng ứng phong trào quyên góp, ủng hộ đồng bào bị lũ lụt, các hoàn cảnh khó khăn tại cơ quan Bộ, hưởng ứng phong trào hiến máu tình nguyện…
Đại hội cũng đã đề ra phương hướng, nhiệm vụ công tác Đoàn và phong trào thanh niên nhiệm kỳ 2017 - 2019. Theo đó, tiếp tục kế thừa và phát huy những thành quả đã đạt được trong nhiệm kỳ trước, đồng thời căn cứ vào định hướng của cấp ủy Đảng, của Đoàn thanh niên Bộ Y tế và nhiệm vụ công tác của Bộ Y tế, Đoàn thanh niên Cơ quan Bộ tiếp tục tăng cường công tác giáo dục chính trị - tư tưởng; đổi mới và nâng cao tính hiệu quả các phong trào thanh niên, xây dựng các mô hình hoạt động phù hợp và đa dạng với từng đối tượng; nâng cao chất lượng tổ chức cơ sở Đoàn; đoàn kết, sáng tạo, xung kích tình nguyện, thực hiện các nhiệm vụ chính trị, nhiệm vụ chuyên môn của cơ quan Bộ Y tế, góp phần xây dựng cơ quan Bộ Y tế vững mạnh; tích cực tham gia các hoạt động phong trào, đoàn thể, hoạt động tình nguyện vì sức khỏe cộng đồng. Khẩu hiệu hành động của tuổi trẻ Bộ Y tế trong nhiệm kỳ tới là: "Tuổi trẻ cơ quan Bộ Y tế đoàn kết, sáng tạo, xung kích, tình nguyện, vì sức khỏe cộng đồng". Đối với ngành Y tế, trước tình hình đầu tư cho y tế còn nhiều khó khăn, tình hình dịch bệnh diễn biến phức tạp, nhiều vấn đề của ngành Y tế tuy đã có những cải thiện nhưng vẫn còn nhiều khó khăn, bất cập, Đảng ủy, Lãnh đạo Bộ Y tế đã chỉ đạo toàn ngành y tế thực hiện 03 đột phá nhằm "Nâng cao chất lượng khám chữa bệnh", "đổi mới phong cách, thái độ phục vụ hướng tới sự hài lòng của người bệnh” với phương châm "lấy người bệnh làm trung tâm phục vụ”. Thực hiện chủ trương của Đảng ủy, Lãnh đạo Bộ Y tế, các đoàn viên Thanh niên cơ quan Bộ Y tế luôn tích cực học tập, phấn đấu, rèn luyện để trở thành những cán bộ, công chức, viên chức gương mẫu của Cơ quan Bộ. ...
Phát biểu tại Đại hội, Bộ trưởng Nguyễn Thị Kim Tiến khẳng định vai trò quan trọng của Đoàn Thanh niên đối với sự phát triển của Bộ, ngành. Điểm lại các thành tích nổi bật, rõ nét của Đoàn Thanh niên Bộ Y tế, Bộ trưởng ghi nhận và đánh giá cao những kết quả đã đạt được trong thời gian qua của Đoàn TNCS HCM Cơ quan Bộ Y tế. Với các phương hướng đề ra trong nhiệm kỳ tới, Bộ trưởng nhấn mạnh: Với sức mạnh của tuổi trẻ, khí thế của thanh niên và lý tưởng hoài bão, khát vọng vươn lên để xây dựng đất nước phát triển, các Đoàn viên thanh niên cần tham gia tích cực, thiết thực, cụ thể hơn để hoàn thành tốt nhiệm vụ chính trị, chuyên môn của Bộ, ngành góp phần hoàn thành nhiện vụ chăm sóc sức khoẻ người dân. Bên cạnh đó, các Đoàn viên cần tham gia xây dựng chính sách và thực hiện tốt Nghị quyết 04 về thực hiện đẩy lùi suy thoái, Nghị quyết 05 về Học tập và là theo tấm gương đạo đức Hồ Chí Minh. Đặc biệt, Bộ trưởng lưu ý, mỗi đoàn viên thanh niên cần đề ra cho mình một đích phấn đấu, cần tìm tòi, sáng tạo, chủ động, nâng cao kiến thức chuyên môn để phát triển nghề nghiệp, đẩy mạnh công tác dự phòng, phát triển y tế cơ sở, nâng cao chất lượng khám chữa bệnh. Bộ trưởng mong rằng, Ban Chấp hành khóa VI sẽ phát huy những kết quả đã được được và đưa công tác đoàn lên bước phát triển mới, đồng thời lưu ý, công tác Đoàn phải thiết thực, hiệu quả, gắn liền với công tác chuyên môn của Bộ, ngành.
Tại Đại hội, các đại biểu và đoàn viên tham dự đã tiến hành giới thiệu và bầu 15 đồng chí vào Ban chấp hành Đoàn TNCS HCM Cơ quan Bộ Y tế nhiệm kỳ 2017 - 2019, bầu Đoàn đại biểu đi dự Đại hội đại biểu Đoàn khối các cơ quan Trung ương. Ban chấp hành Đoàn TN Cơ quan Bộ nhiệm kỳ mới đã họp thống nhất bầu đồng chí Nguyễn Anh Quang giữ chức vụ Bí thư, đồng chí Nguyễn Hải Hoàng và đồng chí Nguyễn Thanh An giữ chức vụ Phó Bí thư. Với tinh thần đoàn kết, nhất trí cao, Đại hội Đoàn TNCS HCM Cơ quan Bộ đã thành công tốt đẹp.
Nam Nguyên