Theo TS. Doãn Ngọc Hải, Viện Sức khỏe nghề nghiệp và môi trường là Viện đầu ngành quốc gia về lĩnh vực sức khỏe nghề nghiệp, vệ sinh và sức khỏe môi trường và vệ sinh và sức khỏe trường học. Căn cứ Quy chế tổ chức và hoạt động của Viện Sức khỏe nghề nghiệp và môi trường, ban hành kèm theo Quyết định số 3456/QĐ- BYT ngày 18.8.2015 của Bộ trưởng Bộ Y tế, nhiệm vụ chỉ đạo tuyến của Viện gồm: giúp Bộ trưởng Bộ Y tế chỉ đạo công tác chuyên môn, kỹ thuật thuộc chuyên ngành; tổ chức thực hiện các chương trình quốc gia, quốc tế về sức khỏe nghề nghiệp, vệ sinh và sức khỏe môi trường và vệ sinh và sức khỏe trường học, phòng chống tai nạn thương tích; hướng dẫn, tư vấn, kiểm tra, giám sát, đánh giá việc thực hiện chuyên môn, kỹ thuật tại các cơ sở làm công tác sức khỏe nghề nghiệp, vệ sinh và sức khỏe môi trường và vệ sinh và sức khỏe trường học trong cả nước; phối hợp xem xét hồ sơ công bố của các đơn vị thực hiện đo, kiểm tra môi trường lao động khi có yêu cầu của cơ quan có thẩm quyền; đánh giá, phối hợp thẩm định năng lực chuyên môn, kỹ thuật các cơ sở y tế chuyên ngành khi có yêu cầu của cơ quan có thẩm quyền.
Thực hiện nhiệm vụ được giao về công tác phụ trách và hỗ trợ chuyên môn cho 28 trung tâm y tế dự phòng các tỉnh phía Bắc, Viện đã tích cực chủ động nâng cao năng lực chuyên môn, phát triển các kỹ thuật mới, đăng ký đầy đủ hệ thống quản lý chất lượng đủ điều kiện quan trắc, đo môi trường cũng như cập nhật các thông tư, kiến thức mới để đảm bảo đáp ứng yêu cầu hỗ trợ cho các Trung tâm y tế dự phòng. Ngoài ra, Viện tham gia góp ý xây dựng các văn bản quy phạm pháp luật thuộc lĩnh vực Viện phụ trách; giám sát thực hiện các Chương trình quốc gia như mô hình phòng chống bệnh nghề nghiệp, chương trình nước sạch và vệ sinh môi trường, vệ sinh nhà tiêu hộ gia đình; phối hợp xem xét hồ sơ công bố của các đơn vị thực hiện đo, kiểm tra môi trường lao động và tham gia đánh giá, phối hợp thẩm định năng lực chuyên môn, kỹ thuật các cơ sở y tế chuyên ngành khi có yêu cầu; kiểm tra, giám sát tiến độ và hỗ trợ thực hiện Chuẩn quốc gia Trung tâm y tế dự phòng tỉnh…
